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Coproculture
La coproculture a pour objet de mettre en évidence la bactérie res-
ponsable d’une diarrhée infectieuse.
Indications
•
•
•
Diarrhée chez un enfant de moins de 2 ans.
Syndrome hémolytique et urémique de l’enfant.
Diarrhée au retour d’un voyage en zone tropicale ou apparue à
l’occasion d’une antibiothérapie.
•
•
Toxi-infection alimentaire collective.
Détection de portages bactériens chez le personnel de restauration.
Prélèvementꢀ
M
Les selles sont recueillies dans un récipient propre. Il en est prélevé
aussitôt une petite quantité (une noix) qui est mise dans un tube
stérile à l’aide d’une spatule et portée aussitôt au laboratoire (si
cette condition ne peut être remplie, il est possible de conserver à
4
°C pendant quelques heures).
Il est possible de se contenter d’un écouvillonnage rectal (nourris-
son et recherche de portage de bactéries).
Technique
Salmonelles, Shigella, Campylobacter (et parfois Yersinia) sont les
germes recherchés systématiquement par le laboratoire par ense-
mencement sur milieux sélectifs.
Les autres germes doivent faire l’objet d’une demande explicite : E. coli O157.
H7, Klebsiella oxytoca en cas de diarrhée, Clostridium difficile en cas d’antibio-
thérapie en cours ou récente.
Si le diagnostic est urgent (gastro-entérites infantiles), il est possi-
ble de demander un examen en immunofluorescence directe sur
les selles.
Résultats
En cas de diarrhée sanglante et fébrile, la coproculture permet de
reconnaître une shigellose (S. sonnei ou S. flexneri) ou, chez l’adulte
jeune entre 15 et 25 ans, une infection à Campylobacter, deux
infections qui ne sont mises en évidence que par la coproculture,
les hémocultures étant constamment négatives.
Au cours d’une diarrhée postantibiothérapie, la présence de leu-
cocytes dans les selles et la mise en évidence de C. difficile concou-
rent au diagnostic de colite pseudo-membraneuse, imposant l’arrêt
immédiat des atropiniques et des antibiotiques.
B
C
D
E
Au retour d’un pays en voie de développement, la persistance inha-
bituelle (au-delà de trois semaines) d’une «diarrhée des voyageurs»
impose de rechercher le germe en cause – un colibacille entérotoxi-
nogène (ETEC) dans plus de 50 % des cas.
F
En cas de typhoïde, la coproculture peut isoler Salmonella typhi, ou
l’une des trois Salmonella paratyphi, alors que l’hémoculture est
négative. La négativité de deux coprocultures à quinze jours d’in-
tervalle est exigée pour affirmer la guérison.
G
H
I
Dans les salmonelloses dites «mineures» (S. typhi murium, S. enteritidis,
S. wien, etc.), un portage asymptomatique peut persister jusqu’à qua-
tre semaines après la guérison clinique. Il est utile de dépister ces por-
teurs surtout chez les professionnels de l’alimentation.
J
K
L
Chez le nourrisson, le caractère épidémique d’une diarrhée (crèches,
services hospitaliers) fait rechercher en priorité à la coproculture un
E. coli entéropathogène (EPEC).
M
N
O
P
Chez l’enfant un syndrome hémolytique et urémique fait rechercher
une infection à E. coli 0157.H7 traduite par une gastro-entérite bru-
tale. La shigatoxine responsable peut être mise en évidence par PCR.
Remarque : les bactéries présentes dans les selles sont loin d’être
toujours pathogènes. Il ne faut pas se laisser abuser par un résultat
positif (voir à ce sujet le tableau ci-dessous).
Q
R
S
Bactéries habituellement présentes
dans les selles
Bactéries souvent présentes dans les selles
•
•
•
•
E. Coli
• Staphylococcus aureus
• Clostridium perfringens
• Lactobacillus
T
Streptococcus fœcalis (entérocoques)
Bactéroides fragilis
U
V
W
X
Y
Z
Proteus, Klebsiella, Enterobacter
• Candida albicans (champignon)
Si l’on suspecte une diarrhée à staphylocoques, il est inutile de
rechercher le staphylocoque dans les selles où sa présence ne prouve
rien. C’est dans l’aliment suspect qu’il faut le mettre en évidence.
L’antibiogramme des bactéries isolées par la coproculture ne doit
pas être systématique.